初生成的多肽链不具备蛋白质的活性,需经加工、修饰后才能成为有活性的蛋白质：
1、甲酰甲硫氨酸切除翻译过程以甲酰甲硫氨酰-tRNA作为起始物质，而天然蛋白质一般不以甲酰甲硫氨酸为N-端的第1位氨基酸，细胞内的氨基肽酶可将其切除。
2、肽段切除某些肽链合成后只是活性蛋白质的前体，需经水解去除部分肽段后才能转变成有活性的蛋白质。如酶原激活、大分子多肽前体水解生成数种小分子活性肽等。
3、个别氨基酸的共价修饰如肽链中空间位置相近的两个半胱氨酸之间氧化形成二硫键，胶原蛋白前体的脯氨酸和赖氨酸残基的羟化，以及酪蛋白中某些氨基酸的磷酸化等。
4、亚基聚合和辅基的连接具有四级结构的蛋白质由两条以上多肽链构成，这些多肽链作为该蛋白质的亚基，通过非共价聚合形成寡聚体。
结合蛋白质的肽链部分必须和辅基连接后才能形成完整的活性蛋白质。
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